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吳德銘出生于1938年5月14日，江蘇省吳縣人，1961年4月畢業于中國人民解放軍軍事工程學院空軍工程系空氣動力學專業，1963年6月加入中國共產黨。自畢業起留校任教，畢生躬耕于祖國國防科技高等教育事業，始終與哈爾濱工程大學的建設發展休戚與共、緊密相依。歷任助教、講師、副教授、教授、博士生導師、校學術委員會主任等職務，1988年10月至1997年12月任哈爾濱船舶工程學院院長、哈爾濱工程大學校長。于2008年5月退休，享受正局級待遇。

吳德銘長期從事空氣動力學和流體力學的教學與科研。1978年獲全國科學大會獎，上世紀80年代應邀赴美國加州理工學院進行非線性波浪理論研究并取得重大成果。發表的“運動表面壓力擾動產生的三元非線性長波”解決了流體力學界重大問題。這一創造性成果被國際學術界許多研究論文引用，得到國內外同行專家的公認并給予高度評價。曾多次應邀赴國外作專題學術報告。曾任中國造船工程學會常務理事、黑龍江省造船學會理事長、黑龍江省航空學會副理事長、黑龍江省科協副主席。