在生命的微觀世界里,蛋白質(zhì)常常需像士兵列陣或信使集結(jié)般“組隊”行動,以執(zhí)行關(guān)鍵任務。曹龍興說:“若能操控這一過程,便掌握了干預生命活動的‘開關(guān)’,如可精準激活治療基因、阻斷病毒入侵等。然而,人為‘指揮’蛋白質(zhì)動態(tài)聚散一直是巨大挑戰(zhàn)。天然界中能響應小分子藥物指令的蛋白質(zhì)極少,而既有的人工系統(tǒng)又常受限于毒性、代謝快或形態(tài)單一等問題。即便人工智能預測蛋白質(zhì)靜態(tài)結(jié)構(gòu)已取得進展,也難以洞察小分子如何動態(tài)‘指揮’蛋白質(zhì)組隊的過程。”
他們開發(fā)了新的蛋白質(zhì)設計工具包,依托學校超算集群進行大規(guī)模計算設計,并在實驗條件初創(chuàng)的艱辛中開始了長達三年的反復嘗試與優(yōu)化。最初人人澡在線,團隊設計由單個金剛烷胺分子誘導蛋白質(zhì)三聚體,但效果微弱。轉(zhuǎn)而設計由兩個金剛烷胺共同作用的系統(tǒng)后,實驗迎來了轉(zhuǎn)機。在眾多候選者中人人澡在線,蛋白質(zhì)dAIT17脫穎而出,在加入藥物后能穩(wěn)定聚合成三聚體,且晶體結(jié)構(gòu)證實其與設計模型高度吻合。進一步優(yōu)化后得到的dAIT17s,靈敏度更高,且在沒有藥物時完全保持“解散”狀態(tài),實現(xiàn)了對蛋白質(zhì)“聚散”的精準開關(guān)控制。
“為確保這套系統(tǒng)在活體中同樣有效,研究進入了關(guān)鍵的細胞與動物驗證階段。實驗結(jié)果令人振奮:在細胞內(nèi),新系統(tǒng)成功實現(xiàn)了由藥物精準調(diào)控的基因開關(guān)激活、特定蛋白質(zhì)的定位引導以及蛋白質(zhì)相變調(diào)控;在小鼠實驗中,靜脈注射攜帶該系統(tǒng)和報告基因的質(zhì)粒后,僅通過口服金剛烷胺,便成功激活了小鼠肝臟內(nèi)的報告基因表達。”解明岐表示:“這預示了未來基因治療的一種嶄新可能:患者只需打一針攜帶治療基因的載體,而這種載體只有在金剛烷胺出現(xiàn)時才會被激活。需要時,口服一片金剛烷胺,就能精準啟動;想停止治療時,停藥即可。”
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